【2018ESMO】吉因加3项学术成果入选壁报展示

10月23日,2018年欧洲肿瘤内科学会年会(European Society for Medical Oncology ,ESMO)在德国慕尼黑落下帷幕。作为欧洲地区最负盛名的肿瘤学术会议,本届年会吸引了来自全球20000多位肿瘤领域专家学者参会,共同分享和探讨国际最前沿的肿瘤学科研究进展。

令人欣喜的是,吉因加3项学术成果入选本次大会壁报(poster)展示,其中1项更被选为壁报讨论(poster discussion)。这是继ASCO、WCLC之后,吉因加学术成果再次获得国际肿瘤盛会认可。

吉因加始终坚持“学术、专业”的精神,聚焦肿瘤精准医疗。目前,公司已积累70000例样本数据,建立肿瘤基因大数据平台。与国内外200多家顶级医疗机构建立科研合作,发表SCI文章20余篇,被ASCO、WCLC等大会接收摘要超过60篇,具有较强的科研实力。下面是此次大会入选3项成果的详细内容。


Discussion Poster I


肺腺鳞癌基因组突变谱及免疫组库研究

Genomic profile and T cell receptor repertoire of two cell components adenocarcinomas and squamous cell carcinomas in lung adenosquamous carcinomas


合作团队

福建省肿瘤医院林根教授团队


研究内容

本研究收集28例肺腺鳞癌患者组织样本,利用显微切割的方法获取腺癌成分(ACC)和鳞癌成分(SCCC),运用吉因加1021大panel进行捕获测序,分析两种组分的突变频谱、TMB状态和进化路径,并分别与吉因加本地腺癌和鳞癌数据库比较,分析腺鳞癌与腺癌和鳞癌的异同。同时采用IR-seq技术,比较两种成分TCR的diversity和clonality指数。结果显示,79%的ACC和75%的SCCC样品具有EGFR突变,46%的ACC和64%的SCCC样品具有TP53突变。与肺腺癌(AC)相比,在ACC中EGFR、MAP3K1等突变基因更显著地富集,但未发现KRAS。与肺鳞癌(SCC)相比,在SCCC中EGFR同样显著富集,但TP53、CDNKN2A等突变基因的发生率更低。SCCC和ACC中普遍存在共有(主干的)突变,以EGFR和TP53最常见,表明ASC中的SCCC和ACC具有相同的起源。ACC和SCCC之间的TMB状态和TCR的多样性都存在存在显着差异。


研究亮点

本研究加深对肺腺鳞癌的认识,结果支持ACC和SCCC为同一起源的研究假设。同时发现两种组分表现出不同的基因组谱、TMB状态和TCR谱。


Poster II


ctDNA NGS测序作为转移性结直肠癌的预后和预测的分子标记物

Circulating tumor DNA by next generation sequencing as a prognostic and predictive biomarker in metastatic colorectal cancer


合作团队

北京协和医院白春梅教授团队


研究内容

本研究入组20例初诊未经治疗的mCRC患者,收集化疗前和化疗4个周期后(C4)患者的血浆ctDNA和血清CEA进行分析。采用吉因加1021大Panel进行深度靶向测序,mClone算法分析肿瘤异质性,mTBI算法评估肿瘤负荷。结果显示,患者基线期mTBI越低的患者,治疗获益越好,mTBI和PFS之间存在显著负相关(Spearman相关系数P = 0.0083,r = -0.5725)。在80%(16/20)的患者可观察到4周期的化疗后的mTBI对比基线期发生倍数性的变化,并且在有应答组和无应答组之间观察到mTBI变化倍数有统计学差异。研究发现mTBI的倍数性变化和PFS之间呈负相关(Spearman相关系数P = 0.0023,r = -0.7201)。


研究亮点

本研究发现,基线期mTBI和PFS呈负相关性,mTBI倍数变化(治疗前对比C4后)与患者PFS之间也存在负相关性。因此,ctDNA是mCRC患者预后和疗效的潜在生物标志物。


Poster III


基于NGS的早期乳腺癌肿瘤组织的基因突变分析

Genetic Alterations of Early-Stage Breast Cancers by next generation sequencing (NGS)


合作团队

重庆大坪医院徐琰教授团队


研究内容

本研究回顾性地分析了53份手术切除组织(2例双侧乳腺癌)基于吉因加1021panel的检测结果,包括29例HR+/HER2-,6例HER2+,6例HR+/HER2+和12例TNBC。结果显示,TP53和PIK3CA突变发生率较高,4组均有检出。检出多个PIK3CA激活突变,其中H1047R/L突变具有广泛性,4组均有检出。具有用药指导意义的突变主要来自16个基因,涉及到多个信号通路。BRCA1胚系突变在1例TNBC患者检出,BRCA2胚系突变在2例HR+/HER2-患者检出。其它基因变异在4组中差异较大。HRAS或KRAS突变通常和其它基因突变共存,HRAS/PIK3CA和KRAS/AKT1共突变分别在2例HR+/HER2-患者中检出,KRAS/PIK3CA共突变在1例TNBC中检出。在2例双侧乳腺癌患者中,肿瘤组织病理亚型均不同;患者1的两个组织共检出14个基因变异,2个变异重复(表2);患者2的两个肿瘤组织中共6个变异,无重复。


研究亮点

本研究发现不同病理亚型的早期乳腺癌患者,其基因变异存在差异,可能导致不同的复发风险。